Makmal Kejuruteraan Makanan merupakan makmal yang terletak dibawah sub kluster Teknologi Makanan, Biodiversiti dan Pemuliharaan. Makmal ini mampu memuatkan seramai 30 orang pelajar pada satu masa. Antara kursus yang dijalankan di makmal ini adalah Unit Operation, Food Engineering, Food Packaging dan sebagainya. Selain set ujikaji, makmal ini juga dilengkapi dengan alat siaraya, projektor dan skrin projektor sebagai alat bantuan mengajar.